MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015183	TCA	2	6	133529	133534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291571
2502	NC_015183	GCC	2	6	133582	133587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291571
2503	NC_015183	GGT	2	6	133596	133601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291571
2504	NC_015183	GGGC	2	8	133626	133633	0 %	0 %	75 %	25 %	325291571
2505	NC_015183	CGC	2	6	133637	133642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291571
2506	NC_015183	ATC	2	6	133672	133677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291571
2507	NC_015183	GATGC	2	10	133690	133699	20 %	20 %	40 %	20 %	325291571
2508	NC_015183	CAA	2	6	133746	133751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291571
2509	NC_015183	TGG	2	6	133792	133797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291571
2510	NC_015183	GC	3	6	133830	133835	0 %	0 %	50 %	50 %	325291571
2511	NC_015183	GGTG	2	8	133836	133843	0 %	25 %	75 %	0 %	325291571
2512	NC_015183	CGG	2	6	133865	133870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291571
2513	NC_015183	CGG	2	6	133961	133966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291571
2514	NC_015183	CGGC	2	8	133985	133992	0 %	0 %	50 %	50 %	325291571
2515	NC_015183	CGC	2	6	134010	134015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291571
2516	NC_015183	GCCGGT	2	12	134037	134048	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325291571
2517	NC_015183	C	6	6	134209	134214	0 %	0 %	0 %	100 %	325291571
2518	NC_015183	GTT	2	6	134281	134286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291572
2519	NC_015183	AGA	2	6	134469	134474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291572
2520	NC_015183	GCCC	2	8	134514	134521	0 %	0 %	25 %	75 %	325291572
2521	NC_015183	GCG	2	6	134523	134528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291572
2522	NC_015183	AGA	2	6	134538	134543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291572
2523	NC_015183	TGG	2	6	134684	134689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291573
2524	NC_015183	GCGAT	2	10	134765	134774	20 %	20 %	40 %	20 %	325291573
2525	NC_015183	GCG	2	6	134813	134818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291573
2526	NC_015183	TGG	2	6	134840	134845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291573
2527	NC_015183	TGA	2	6	134870	134875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291573
2528	NC_015183	CCGG	2	8	134882	134889	0 %	0 %	50 %	50 %	325291573
2529	NC_015183	GC	3	6	134925	134930	0 %	0 %	50 %	50 %	325291573
2530	NC_015183	CAGG	2	8	134997	135004	25 %	0 %	50 %	25 %	325291573
2531	NC_015183	ATT	2	6	135047	135052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291573
2532	NC_015183	AG	3	6	135078	135083	50 %	0 %	50 %	0 %	325291573
2533	NC_015183	TCG	2	6	135095	135100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291573
2534	NC_015183	CG	3	6	135157	135162	0 %	0 %	50 %	50 %	325291573
2535	NC_015183	CGG	2	6	135177	135182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291573
2536	NC_015183	CGG	2	6	135221	135226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291573
2537	NC_015183	GCT	2	6	135243	135248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291573
2538	NC_015183	TTA	2	6	135332	135337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291573
2539	NC_015183	GCTGA	2	10	135364	135373	20 %	20 %	40 %	20 %	325291573
2540	NC_015183	GGC	2	6	135406	135411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291573
2541	NC_015183	TGC	2	6	135420	135425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291573
2542	NC_015183	GAAA	2	8	135432	135439	75 %	0 %	25 %	0 %	325291573
2543	NC_015183	AGG	2	6	135447	135452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291573
2544	NC_015183	CG	3	6	135478	135483	0 %	0 %	50 %	50 %	325291574
2545	NC_015183	TGC	2	6	135554	135559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291574
2546	NC_015183	CCG	2	6	135595	135600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291574
2547	NC_015183	TCG	2	6	135622	135627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291574
2548	NC_015183	GTC	2	6	135678	135683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291574
2549	NC_015183	GTG	2	6	135717	135722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291574
2550	NC_015183	GGC	2	6	135734	135739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291574
2551	NC_015183	CGA	2	6	135755	135760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291574
2552	NC_015183	TGG	2	6	135823	135828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291574
2553	NC_015183	TTC	2	6	135859	135864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291574
2554	NC_015183	TCG	2	6	135911	135916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291574
2555	NC_015183	TCA	2	6	135952	135957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291574
2556	NC_015183	GCC	2	6	135999	136004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291574
2557	NC_015183	CAG	2	6	136031	136036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291574
2558	NC_015183	CGG	2	6	136061	136066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291574
2559	NC_015183	GAT	2	6	136176	136181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291574
2560	NC_015183	GCC	2	6	136218	136223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291574
2561	NC_015183	ATC	2	6	136253	136258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291575
2562	NC_015183	CGC	2	6	136259	136264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291575
2563	NC_015183	AGGCC	2	10	136342	136351	20 %	0 %	40 %	40 %	325291575
2564	NC_015183	CGA	2	6	136393	136398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291575
2565	NC_015183	TGG	2	6	136401	136406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291575
2566	NC_015183	TGTCC	2	10	136438	136447	0 %	40 %	20 %	40 %	325291575
2567	NC_015183	CGG	2	6	136489	136494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291575
2568	NC_015183	GCC	2	6	136535	136540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291575
2569	NC_015183	GAT	2	6	136558	136563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291575
2570	NC_015183	CGG	2	6	136588	136593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291575
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2572	NC_015183	ATC	2	6	136685	136690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291575
2573	NC_015183	AAG	2	6	136796	136801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291575
2574	NC_015183	GGA	2	6	136870	136875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291575
2575	NC_015183	CGA	2	6	136929	136934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291575
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2577	NC_015183	GGT	2	6	137050	137055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291575
2578	NC_015183	TGC	2	6	137065	137070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291575
2579	NC_015183	AGGCG	2	10	137113	137122	20 %	0 %	60 %	20 %	325291575
2580	NC_015183	GCC	2	6	137132	137137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291575
2581	NC_015183	TCC	2	6	137141	137146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291575
2582	NC_015183	GCA	2	6	137180	137185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291575
2583	NC_015183	ATC	2	6	137211	137216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291575
2584	NC_015183	GGCT	2	8	137273	137280	0 %	25 %	50 %	25 %	325291575
2585	NC_015183	CG	3	6	137295	137300	0 %	0 %	50 %	50 %	325291575
2586	NC_015183	GGC	3	9	137327	137335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291575
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2588	NC_015183	TCGG	2	8	137366	137373	0 %	25 %	50 %	25 %	325291575
2589	NC_015183	AAG	2	6	137451	137456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291575
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2592	NC_015183	GCC	2	6	137707	137712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291576
2593	NC_015183	GCC	2	6	137777	137782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291576
2594	NC_015183	GCG	2	6	137863	137868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291576
2595	NC_015183	CCA	2	6	137905	137910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291576
2596	NC_015183	CCA	2	6	137993	137998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291576
2597	NC_015183	CAA	2	6	138057	138062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291576
2598	NC_015183	GCT	2	6	138265	138270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291577
2599	NC_015183	CAGC	2	8	138340	138347	25 %	0 %	25 %	50 %	325291577
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2601	NC_015183	GGA	2	6	138407	138412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291577
2602	NC_015183	CGA	3	9	138436	138444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291577
2603	NC_015183	AC	3	6	138520	138525	50 %	0 %	0 %	50 %	325291577
2604	NC_015183	CTT	2	6	138614	138619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291577
2605	NC_015183	GCG	2	6	138652	138657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291577
2606	NC_015183	CG	3	6	138688	138693	0 %	0 %	50 %	50 %	325291577
2607	NC_015183	AGCAG	2	10	138703	138712	40 %	0 %	40 %	20 %	325291577
2608	NC_015183	GGC	2	6	138733	138738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291577
2609	NC_015183	CTT	2	6	138761	138766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291577
2610	NC_015183	ATG	2	6	138771	138776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291577
2611	NC_015183	AGC	2	6	138945	138950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291578
2612	NC_015183	CAGC	2	8	139042	139049	25 %	0 %	25 %	50 %	325291578
2613	NC_015183	AGA	2	6	139075	139080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291578
2614	NC_015183	TCG	2	6	139089	139094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291578
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2616	NC_015183	GCG	2	6	139236	139241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291578
2617	NC_015183	GC	3	6	139251	139256	0 %	0 %	50 %	50 %	325291578
2618	NC_015183	CGA	2	6	139300	139305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291578
2619	NC_015183	ATGG	2	8	139334	139341	25 %	25 %	50 %	0 %	325291578
2620	NC_015183	CTC	2	6	139409	139414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291578
2621	NC_015183	TGC	2	6	139457	139462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291578
2622	NC_015183	GCC	2	6	139470	139475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291578
2623	NC_015183	GAT	2	6	139517	139522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291578
2624	NC_015183	TCTTT	2	10	139540	139549	0 %	80 %	0 %	20 %	325291578
2625	NC_015183	GA	3	6	139578	139583	50 %	0 %	50 %	0 %	325291578
2626	NC_015183	GAT	2	6	139628	139633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291578
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2741	NC_015183	CGA	2	6	145094	145099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291583
2742	NC_015183	GCC	2	6	145107	145112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291583
2743	NC_015183	CGA	2	6	145136	145141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291583
2744	NC_015183	CAGC	2	8	145298	145305	25 %	0 %	25 %	50 %	325291584
2745	NC_015183	GTTTC	2	10	145311	145320	0 %	60 %	20 %	20 %	325291584
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2754	NC_015183	CCTT	2	8	145754	145761	0 %	50 %	0 %	50 %	325291584
2755	NC_015183	TGA	2	6	145764	145769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291584
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2762	NC_015183	GGTG	2	8	146046	146053	0 %	25 %	75 %	0 %	325291584
2763	NC_015183	GAT	2	6	146083	146088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291584
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2863	NC_015183	CAA	2	6	151160	151165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291587
2864	NC_015183	GCT	2	6	151280	151285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291587
2865	NC_015183	GCG	2	6	151327	151332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291587
2866	NC_015183	CCGCA	2	10	151382	151391	20 %	0 %	20 %	60 %	325291587
2867	NC_015183	GC	3	6	151471	151476	0 %	0 %	50 %	50 %	325291587
2868	NC_015183	GCC	2	6	151485	151490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291587
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2882	NC_015183	TGC	2	6	152068	152073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291587
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2893	NC_015183	TCT	2	6	152357	152362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291587
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2973	NC_015183	CCACG	2	10	156203	156212	20 %	0 %	20 %	60 %	325291589
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2977	NC_015183	TCAT	2	8	156318	156325	25 %	50 %	0 %	25 %	325291590
2978	NC_015183	GTCG	2	8	156332	156339	0 %	25 %	50 %	25 %	325291590
2979	NC_015183	GAT	2	6	156404	156409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291590
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2981	NC_015183	GCA	2	6	156442	156447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291590
2982	NC_015183	TA	3	6	156575	156580	50 %	50 %	0 %	0 %	325291590
2983	NC_015183	T	6	6	156593	156598	0 %	100 %	0 %	0 %	325291590
2984	NC_015183	TCA	2	6	156603	156608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291590
2985	NC_015183	CTG	2	6	156678	156683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291590
2986	NC_015183	GAC	2	6	156728	156733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291590
2987	NC_015183	GAT	2	6	156767	156772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291590
2988	NC_015183	GAC	2	6	156779	156784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291590
2989	NC_015183	GCT	2	6	156822	156827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291590
2990	NC_015183	GA	3	6	157095	157100	50 %	0 %	50 %	0 %	325291591
2991	NC_015183	GGGT	2	8	157108	157115	0 %	25 %	75 %	0 %	325291591
2992	NC_015183	CGC	2	6	157165	157170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291591
2993	NC_015183	CAG	2	6	157184	157189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291591
2994	NC_015183	CCG	2	6	157203	157208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291591
2995	NC_015183	TCG	2	6	157212	157217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291591
2996	NC_015183	CCG	2	6	157229	157234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291591
2997	NC_015183	GC	4	8	157269	157276	0 %	0 %	50 %	50 %	325291591
2998	NC_015183	CG	3	6	157342	157347	0 %	0 %	50 %	50 %	325291591
2999	NC_015183	GTCAGC	2	12	157449	157460	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325291591
3000	NC_015183	TCA	2	6	157477	157482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291591

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